要顺利通过水舰队基地，首先需要完成火岩队基地的全部剧情。在凯那市码头触发水舰队偷取潜水艇的剧情后，立即前往水静市右下角海域。使用冲浪技能进入水域后，沿着北部方向前进即可发现隐藏的基地入口。基地内部结构复杂，需注意沿途有两个水舰队成员正在训练鲸鱼，无需与之交战。
第一个关键点是使用碎岩术击碎挡路的岩石，随后将巨石推至指定位置以开辟通道。继续向右行进时会遇到第二块挡道巨石，同样需要推动清除。基地内部分岔路存在误导性设计，正确路径需选择左上方的洞口进入。该区域存在海流机关，需利用水流冲击抵达不同平台。
穿过海流区域后，将面临水舰队成员的连续对战。其中两名高级干部守在通往核心区域的必经之路上，建议提前准备克制水属性的精灵。战胜他们后进入浓雾笼罩的最终区域，此处地形辨识度较低，需保持向下移动的方向直至触发剧情。盖欧卡沉睡的位置位于最底层，同时水舰队首领水梧桐会在此现身并触发强制战斗。
在击败高级干部的房间里藏有一颗大师球，另有两处隐藏道具金珠和顽皮弹。若需返回基地入口，需注意特定洞穴会直接传送至起点。完成全部剧情后，水梧桐将驾驶潜水艇离开，可前往绿岭市继续后续任务。
该攻略的核心在于准确把握地形机制与剧情触发顺序。基地内部分区域存在视觉干扰，需依靠逻辑推理而非盲目探索。战斗难度集中在后期干部对战，建议携带电系或草系精灵应对。整个流程约需20-30分钟，具体时长取决于对战与解谜效率。
